実験のプロトコール

研究室で行われている実験について，その方法をプロトコール集としてまとめていくことにしました。

１）合成

・Bhc-diazoの合成法
・MOMBhcクロロホルメートの合成
・ヒドロキシル基のケージング（ケージドジアシルグリセロールの合成）
・カルボン酸のケージング（ケージドアミノ酸の合成）
・リン酸のケージング（ケージドcGMPの合成）
・アミノ基のケージング（ケージドアミノ酸およびケージドヌクレオシド）
・ペプチドの固相合成
　　　　＊試薬リスト（とても重いので表示に時間がかかります）

２）ケージド化合物の化学的性質の評価

・実験全体の流れ
・ケージド化合物の光反応の量子収率の求め方
・暗所での安定性の評価
・２光子励起の吸収断面積の測定

３）ケージド化合物のアッセイ

・ケージドcAMPでメダカ黒色素胞の色素顆粒の運動を光制御する
・ケージドcAMPで嗅細胞の情報伝達を再現する
・ケージドmRNAの調製とゼブラフィッシュ初期胚へのインジェクション
・プラスミドDNAのケージングと動物培養細胞へのトランスフェクション
・PKCのキナーゼ活性の測定
・PKCのトランスロケーションの観察
・チューブリンの重合アッセイ
・プラスミドを増やす
・動物培養細胞へのトランスフェクション
・GFPとDsRedの蛍光比からRNAiの効果を見積もる
・デュアルルシフェラーゼアッセイ

４）主な設備・機器の使い方と決まり

・クリーンベンチ
・ガラス器具の洗浄
・HPLCの使い方（Agillent, HP1100）
・UVスペクトル測定（HITACHI, U-3010）
・UVの温度可変測定
・プレートリーダーで吸光度を測る
・蛍光スペクトル測定 （HITACHI, F-2500）
・Ti-Sapphireレーザー（Spectra-Physics, Tsunami）のチューニング
・蛍光顕微鏡（Olympus, IX-71）観察と画像取得（MetaMorph）
・共焦点レーザー走査顕微鏡
・ルミノメーター （TD-20/20）
・PCR
・DNAシークエンサー (Applied
・FACS
・NMR（JEOL, JNM-270GSX）
・IR （Thermo-Nicolet. Avatar 320）
・MALDI-TOF MS
・DNAシンセサイザー
・Quest 210