総胆管結石はビリルビン石灰石であることが多い。原因としては胆道感染が起因で、細菌由来のβ-glucuronidaseの活性により、胆汁中のグロクロン酸抱合ビリルビンがグロクロン酸とビリルビンに分離し、水に不溶性のビリルビンが析出し胆石の核となり、これにビリルビンが沈積して結石となるといわれている。一般に上腹部痛、発熱、黄疸が３大症状とされるが、症状によりさまざまで、三者が揃うことはむしろ少ない。
総胆管結石は胆管拡張の所見があり、急性症状ではＰＴＣＤ(経皮経肝的胆管ドレナージ)やＥＲＣＰ（内視鏡的逆行性胆管膵管造影）によるＥＮＢＤ(内視鏡的経鼻胆管ドレナージ)チューブ挿入などを行い減黄する必要がある。